bio-applied-docking

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v0.0.0Pavel-KravchenkoUnknownAktualisiert vor 3 Mon.Quelle →

Dock ligands into a receptor with AutoDock Vina: build PDBQT files (Open Babel/RDKit), set the grid box, run vina, parse/rank poses by affinity and RMSD. Use for molecular docking, virtual screening, redocking a co-crystal ligand, or PDB/SMILES to PDBQT conversion.

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1Clients
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vor 3 Mon.Letzte Aktualisierung
Skill
AutorPavel-Kravchenko
Version0.0.0
LizenzUnknown
KategorieWorkflow
Formateskill.md
PromptNicht veröffentlicht
Kompatibilität
Claude✓ Unterstützt
Cursor—
Copilot—
ChatGPT—
Gemini—
Über

Dock ligands into a receptor with AutoDock Vina: build PDBQT files (Open Babel/RDKit), set the grid box, run vina, parse/rank poses by affinity and RMSD. Use for molecular docking, virtual screening, redocking a co-crystal ligand, or PDB/SMILES to PDBQT conversion.

Schlagwörter
skillclaude

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