gatk-variant-calling

SKILLWorkflowCommunity
v0.0.0jaechang-hitsNOASSERTIONAktualisiert vor 1 Mon.Quelle →

GATK Best Practices for germline SNP/indel calling from WGS/WES BAMs. Per-sample HaplotypeCaller GVCFs, GenomicsDBImport, GenotypeGVCFs joint calling, VQSR or hard filters. Requires BWA-MEM2-aligned, markdup, BQSR BAMs. Use DeepVariant for a faster DL alternative; GATK is the NIH/ENCODE standard.

Community-submitted skill. Not yet reviewed by the Forge team. Full prompt content may not be available.Request review →
336Repo-Sterne
1Clients
1Formate
vor 1 Mon.Letzte Aktualisierung
Skill
Autorjaechang-hits
Version0.0.0
LizenzNOASSERTION
KategorieWorkflow
Formateskill.md
PromptNicht veröffentlicht
Kompatibilität
Claude✓ Unterstützt
Cursor—
Copilot—
ChatGPT—
Gemini—
Über

GATK Best Practices for germline SNP/indel calling from WGS/WES BAMs. Per-sample HaplotypeCaller GVCFs, GenomicsDBImport, GenotypeGVCFs joint calling, VQSR or hard filters. Requires BWA-MEM2-aligned, markdup, BQSR BAMs. Use DeepVariant for a faster DL alternative; GATK is the NIH/ENCODE standard.

Schlagwörter
skillclaude

Keine Abdeckung der Abhängigkeiten

Dieser Eintrag veröffentlicht kein npm-Paket, daher hat Forge keinen Abhängigkeitsbaum dafür. Das ist eine Lücke in der Abdeckung — keine Aussage, dass er keine Abhängigkeiten hat.