gseapy-gene-enrichment

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GSEA and over-representation analysis (ORA) for RNA-seq and proteomics. Wraps Enrichr for ORA against MSigDB, KEGG, GO, and 200+ databases; runs preranked GSEA on ranked DE gene lists. Outputs enrichment tables and running-score plots. Use after DESeq2 or edgeR for pathway-level interpretation.

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vor 1 Mon.Letzte Aktualisierung
Skill
Autorjaechang-hits
Version0.0.0
LizenzNOASSERTION
KategorieWorkflow
Formateskill.md
PromptNicht veröffentlicht
Kompatibilität
Claude✓ Unterstützt
Cursor—
Copilot—
ChatGPT—
Gemini—
Über

GSEA and over-representation analysis (ORA) for RNA-seq and proteomics. Wraps Enrichr for ORA against MSigDB, KEGG, GO, and 200+ databases; runs preranked GSEA on ranked DE gene lists. Outputs enrichment tables and running-score plots. Use after DESeq2 or edgeR for pathway-level interpretation.

Schlagwörter
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