Rosetta/PyRosetta protein modeling and Biotite translation for computational biology
Author: Ariel J. Ben-Sasson A Model Context Protocol (MCP) server that lets Cursor (or any MCP client) work with Rosetta, PyRosetta, and Biotite: run RosettaScripts, validate XML protocols, translate between Rosetta and Biotite, score structures, and query documentation -- all from your AI coding assistant. -- Find the Biotite equivalent of any Rosetta function with working example code (21…
Abgeleitet aus den Transporten, die dieser Eintrag deklariert (stdio). Ein Client, der hier nicht steht, ist damit nicht ausgeschlossen — Forge kann ihn nur nicht bestätigen.
Die Verifizierung bestätigt die Identität des Publishers (die Inhaberschaft am Repo), nicht die Sicherheit des Codes. Der Sicherheits-Scan deckt bekannte CVEs und verdächtige Installationsskripte ab.
Aus dem Quellcode gelesen, den npm tatsächlich ausliefert, zum Zeitpunkt des Scans. Das Paket wurde nie ausgeführt. Tools, die zur Laufzeit dynamisch registriert werden oder in gebündeltem beziehungsweise minifiziertem Code stecken, können übersehen werden — das hier ist also eine Untergrenze der Tool-Oberfläche, keine vollständige Erhebung.
get_rosetta_infoKeine Beschreibung veröffentlichtDieses Tool hat keine Beschreibung veröffentlicht. Forge erfindet keine.
get_rosetta_helpKeine Beschreibung veröffentlichtDieses Tool hat keine Beschreibung veröffentlicht. Forge erfindet keine.
validate_xmlKeine Beschreibung veröffentlichtDieses Tool hat keine Beschreibung veröffentlicht. Forge erfindet keine.
run_rosetta_scriptsKeine Beschreibung veröffentlichtDieses Tool hat keine Beschreibung veröffentlicht. Forge erfindet keine.
pyrosetta_scoreKeine Beschreibung veröffentlichtDieses Tool hat keine Beschreibung veröffentlicht. Forge erfindet keine.
pyrosetta_introspectKeine Beschreibung veröffentlichtDieses Tool hat keine Beschreibung veröffentlicht. Forge erfindet keine.
rosetta_scripts_schemaKeine Beschreibung veröffentlichtDieses Tool hat keine Beschreibung veröffentlicht. Forge erfindet keine.
get_cached_docsKeine Beschreibung veröffentlichtDieses Tool hat keine Beschreibung veröffentlicht. Forge erfindet keine.
python_env_infoKeine Beschreibung veröffentlichtDieses Tool hat keine Beschreibung veröffentlicht. Forge erfindet keine.
check_pyrosettaKeine Beschreibung veröffentlichtDieses Tool hat keine Beschreibung veröffentlicht. Forge erfindet keine.
install_pyrosetta_installerKeine Beschreibung veröffentlichtDieses Tool hat keine Beschreibung veröffentlicht. Forge erfindet keine.
find_rosetta_scriptsKeine Beschreibung veröffentlichtDieses Tool hat keine Beschreibung veröffentlicht. Forge erfindet keine.
xml_to_pyrosettaKeine Beschreibung veröffentlichtDieses Tool hat keine Beschreibung veröffentlicht. Forge erfindet keine.
search_rosetta_web_docsKeine Beschreibung veröffentlichtDieses Tool hat keine Beschreibung veröffentlicht. Forge erfindet keine.
get_rosetta_web_docKeine Beschreibung veröffentlichtDieses Tool hat keine Beschreibung veröffentlicht. Forge erfindet keine.
rosetta_to_biotiteKeine Beschreibung veröffentlichtDieses Tool hat keine Beschreibung veröffentlicht. Forge erfindet keine.
biotite_to_rosettaKeine Beschreibung veröffentlichtDieses Tool hat keine Beschreibung veröffentlicht. Forge erfindet keine.
translate_rosetta_script_to_biotiteKeine Beschreibung veröffentlichtDieses Tool hat keine Beschreibung veröffentlicht. Forge erfindet keine.
0 von 18 Tools haben eine Beschreibung veröffentlicht.
Tool-Namen und -Beschreibungen stammen vom Publisher und werden wortgetreu als inerter Text angezeigt. Es sind die Zeichenketten, die ein MCP-Client an ein Modell übergibt, deshalb prüft Forge sie auf Prompt-Injection-Muster — jeder Befund erscheint oben beim Sicherheits-Scan. „Privilegiert“ ist ein Schlagwort-Treffer im Tool-Namen, keine Prüfung dessen, was das Tool tut: ein harmlos klingender Name kann trotzdem alles tun.
Author: Ariel J. Ben-Sasson A Model Context Protocol (MCP) server that lets Cursor (or any MCP client) work with Rosetta, PyRosetta, and Biotite: run RosettaScripts, validate XML protocols, translate between Rosetta and Biotite, score structures, and query documentation -- all from your AI coding assistant. ** -- Find the Biotite equivalent of any Rosetta function with working example code (21 mappings covering structure I/O, SASA, RMSD, superimposition, secondary structure, contacts, hydrogen…
Verlinkte Namen öffnen den Forge-Index aller Einträge, bei denen dieses Tool beobachtet wurde. Alle indexierten Tools durchsuchen.
Dieses Paket wurde zuletzt gescannt, bevor Forge den aufgelösten Baum zu speichern begann. Der nächste Scan zeichnet ihn auf.