MCP server for Oliver's mTOR Atlas: evidence-labelled mTOR studies, entities, signed pathway relations with supporting and conflicting evidence, and open questions.
Abgeleitet aus den Transporten, die dieser Eintrag deklariert (stdio, streamable-http). Ein Client, der hier nicht steht, ist damit nicht ausgeschlossen — Forge kann ihn nur nicht bestätigen.
Die Verifizierung bestätigt die Identität des Publishers (die Inhaberschaft am Repo), nicht die Sicherheit des Codes. Der Sicherheits-Scan deckt bekannte CVEs und verdächtige Installationsskripte ab.
Aus dem Quellcode gelesen, den npm tatsächlich ausliefert, zum Zeitpunkt des Scans. Das Paket wurde nie ausgeführt. Tools, die zur Laufzeit dynamisch registriert werden oder in gebündeltem beziehungsweise minifiziertem Code stecken, können übersehen werden — das hier ist also eine Untergrenze der Tool-Oberfläche, keine vollständige Erhebung.
atlas_aboutDataset version, corpus snapshot date, counts, evidence-code legend and how to cite the dataset.Dataset version, corpus snapshot date, counts, evidence-code legend and how to cite the dataset.
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search_studiesSearch the curated studies by keywords (title, finding, authors, journal, model system), optionally filtered by evidence code, a linked entity (gene, drug, disease...) and year range. Returns summary records with evidence codes and URLs.Search the curated studies by keywords (title, finding, authors, journal, model system), optionally filtered by evidence code, a linked entity (gene, drug, disease...) and year range. Returns summary records with evidence codes and URLs.
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get_studyFull record for one study by Atlas ID (e.g. "SAB1994"): abstract excerpt, extracted findings, linked entities, the relations it supports or contradicts, related open questions.Full record for one study by Atlas ID (e.g. "SAB1994"): abstract excerpt, extracted findings, linked entities, the relations it supports or contradicts, related open questions.
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search_entitiesFind genes/proteins, complexes, drugs, diseases, processes, nutrients and outcomes by name or synonym.Find genes/proteins, complexes, drugs, diseases, processes, nutrients and outcomes by name or synonym.
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get_entityOne entity (gene/protein, complex, drug, disease, process...) with its linked studies as short cards (first studies_limit) and every pathway relation it takes part in as a one-line claim. Accepts an id, a name or a synonym.One entity (gene/protein, complex, drug, disease, process...) with its linked studies as short cards (first studies_limit) and every pathway relation it takes part in as a one-line claim. Accepts an id, a name or a synonym.
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find_relationsSigned, evidence-linked pathway relations (claims such as "Rheb activates mTORC1"). Filter by an entity on either end, by source/target, effect, contested status or minimum strength of the best supporting evidence.Signed, evidence-linked pathway relations (claims such as "Rheb activates mTORC1"). Filter by an entity on either end, by source/target, effect, contested status or minimum strength of the best supporting evidence.
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get_relationOne pathway relation by ID (e.g. "RHEB-MTORC1"): mechanism, boundary conditions, confidence, supporting and conflicting studies.One pathway relation by ID (e.g. "RHEB-MTORC1"): mechanism, boundary conditions, confidence, supporting and conflicting studies.
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evidence_betweenDirect curated relations between two entities (either direction) with full cards for the supporting and conflicting studies. Answers questions such as "what is the evidence that A acts on B?".Direct curated relations between two entities (either direction) with full cards for the supporting and conflicting studies. Answers questions such as "what is the evidence that A acts on B?".
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find_contradictionsRelations the Atlas marks as contested or that carry conflicting studies, with both sides of the evidence. Optionally limited to one entity.Relations the Atlas marks as contested or that carry conflicting studies, with both sides of the evidence. Optionally limited to one entity.
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list_questionsThe Atlas's open questions (evidence gaps with testable hypotheses) and frontier questions.The Atlas's open questions (evidence gaps with testable hypotheses) and frontier questions.
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get_questionOne open or frontier question by ID (e.g. "H1", "F2"): the gap, what changed, what is still open, how it could be tested, linked studies.One open or frontier question by ID (e.g. "H1", "F2"): the gap, what changed, what is still open, how it could be tested, linked studies.
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11 von 11 Tools haben eine Beschreibung veröffentlicht.
Tool-Namen und -Beschreibungen stammen vom Publisher und werden wortgetreu als inerter Text angezeigt. Es sind die Zeichenketten, die ein MCP-Client an ein Modell übergibt, deshalb prüft Forge sie auf Prompt-Injection-Muster — jeder Befund erscheint oben beim Sicherheits-Scan. „Privilegiert“ ist ein Schlagwort-Treffer im Tool-Namen, keine Prüfung dessen, was das Tool tut: ein harmlos klingender Name kann trotzdem alles tun.
MCP server for Oliver's mTOR Atlas: evidence-labelled mTOR studies, entities, signed pathway relations with supporting and conflicting evidence, and open questions.
Verlinkte Namen öffnen den Forge-Index aller Einträge, bei denen dieses Tool beobachtet wurde. Alle indexierten Tools durchsuchen.
Der Durchlauf endete an der Tiefengrenze 4. Alles unterhalb dieser Ebene wurde nie aufgelöst.
Der Durchlauf endete an der Grenze von 60 Paketen. Der Rest des Baums wurde nie aufgelöst.
36 weitere aufgelöste Pakete werden hier nicht gezeichnet (Anzeigegrenze: 24). Jede Abhängigkeit mit einem Sicherheitshinweis wird unabhängig von der Grenze gezeichnet. Vollständiges Inventar (CycloneDX-SBOM)
53 deklarierte Abhängigkeiten sind nie im Baum gelandet. Sie fehlen in Forges Auflösung, nicht im Paket.
+41 weitere nicht aufgeführt. Die Zählungen nach Grund oben erfassen sie alle.
Nicht verfolgt: peerDependencies. Dieser Baum erfasst nur Laufzeitabhängigkeiten; was jene mitbringen, wurde nie aufgelöst.