alterlab-deeptools

SKILLFlujo de trabajocomunidad
v0.0.0AlterLab-IEUMITActualizado hace 3 mFuente →

Process and visualize deep-sequencing coverage with the deepTools CLI — convert BAM to bigWig (bamCoverage), build log2 ratio tracks (bamCompare), run QC (multiBamSummary correlation, PCA, plotFingerprint), apply the ATAC-seq Tn5 shift (alignmentSieve --ATACshift), and make TSS/peak heatmaps and pro

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59Estrellas del repo
1Clientes
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hace 3 mÚltima actualización
Skill
AutorAlterLab-IEU
Versión0.0.0
LicenciaMIT
CategoríaFlujo de trabajo
Formatosskill.md
PromptNo publicado
Compatibilidad
Claude✓ Compatible
Cursor—
Copilot—
ChatGPT—
Gemini—
Acerca de

Process and visualize deep-sequencing coverage with the deepTools CLI — convert BAM to bigWig (bamCoverage), build log2 ratio tracks (bamCompare), run QC (multiBamSummary correlation, PCA, plotFingerprint), apply the ATAC-seq Tn5 shift (alignmentSieve --ATACshift), and make TSS/peak heatmaps and profiles (computeMatrix, plotHeatmap, plotProfile). Use for coverage tracks, signal heatmaps/profiles,

Palabras clave
skillclaude

Sin cobertura de dependencias

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