bakta-genome-annotation

SKILLFlujo de trabajocomunidad
v0.0.0jaechang-hitsNOASSERTIONActualizado hace 1 mFuente →

Annotate bacterial and archaeal genomes and plasmids with Bakta's Prodigal/HMM/diamond pipeline. Identifies CDS, ncRNA, tRNA, rRNA, tmRNA, sORFs, CRISPR arrays, oriC/oriV/oriT, and gaps against a curated UniRef-derived database. Produces NCBI-compatible GFF3, GenBank, EMBL, JSON, FASTA, TSV, and a c

Community-submitted skill. Not yet reviewed by the Forge team. Full prompt content may not be available.Request review →
336Estrellas del repo
1Clientes
1Formatos
hace 1 mÚltima actualización
Skill
Autorjaechang-hits
Versión0.0.0
LicenciaNOASSERTION
CategoríaFlujo de trabajo
Formatosskill.md
PromptNo publicado
Compatibilidad
Claude✓ Compatible
Cursor—
Copilot—
ChatGPT—
Gemini—
Acerca de

Annotate bacterial and archaeal genomes and plasmids with Bakta's Prodigal/HMM/diamond pipeline. Identifies CDS, ncRNA, tRNA, rRNA, tmRNA, sORFs, CRISPR arrays, oriC/oriV/oriT, and gaps against a curated UniRef-derived database. Produces NCBI-compatible GFF3, GenBank, EMBL, JSON, FASTA, TSV, and a circular genome plot. Use Prokka for legacy pipelines or non-bacterial kingdoms; PGAP for NCBI GenBan

Palabras clave
skillclaude

Sin cobertura de dependencias

Esta entrada no publica ningún paquete de npm, así que Forge no tiene un árbol de dependencias para ella. Es una carencia de cobertura, no una afirmación de que no tenga dependencias.