bio-applied-ont-processing

SKILLFlujo de trabajocomunidad
v0.0.0Pavel-KravchenkoUnknownActualizado hace 3 mFuente →

Basecall ONT POD5/FAST5 signal with Dorado (fast/hac/sup, duplex, 5mC/5hmC), QC with NanoStat/NanoPlot, filter with NanoFilt, and align with Minimap2 map-ont. Use for nanopore raw-signal processing, Q-score/length read filtering, N50 computation, or a POD5-to-aligned-BAM pipeline.

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4Estrellas del repo
1Clientes
1Formatos
hace 3 mÚltima actualización
Skill
AutorPavel-Kravchenko
Versión0.0.0
LicenciaUnknown
CategoríaFlujo de trabajo
Formatosskill.md
PromptNo publicado
Compatibilidad
Claude✓ Compatible
Cursor—
Copilot—
ChatGPT—
Gemini—
Acerca de

Basecall ONT POD5/FAST5 signal with Dorado (fast/hac/sup, duplex, 5mC/5hmC), QC with NanoStat/NanoPlot, filter with NanoFilt, and align with Minimap2 map-ont. Use for nanopore raw-signal processing, Q-score/length read filtering, N50 computation, or a POD5-to-aligned-BAM pipeline.

Palabras clave
skillclaude

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