plink2-gwas-analysis

SKILLFlujo de trabajocomunidad
v0.0.0jaechang-hitsNOASSERTIONActualizado hace 1 mFuente →

GWAS and population genetics tool. Processes PLINK (.bed/.bim/.fam), VCF, and BGEN; runs QC (MAF, HWE, missingness), IBD estimation, PCA, and linear/logistic regression GWAS. Outputs Manhattan-ready summary stats. Use regenie or SAIGE for biobanks (>100k samples) needing mixed models.

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336Estrellas del repo
1Clientes
1Formatos
hace 1 mÚltima actualización
Skill
Autorjaechang-hits
Versión0.0.0
LicenciaNOASSERTION
CategoríaFlujo de trabajo
Formatosskill.md
PromptNo publicado
Compatibilidad
Claude✓ Compatible
Cursor—
Copilot—
ChatGPT—
Gemini—
Acerca de

GWAS and population genetics tool. Processes PLINK (.bed/.bim/.fam), VCF, and BGEN; runs QC (MAF, HWE, missingness), IBD estimation, PCA, and linear/logistic regression GWAS. Outputs Manhattan-ready summary stats. Use regenie or SAIGE for biobanks (>100k samples) needing mixed models.

Palabras clave
skillclaude

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