alterlab-blast

SKILLWorkflowcommunauté
v0.0.0AlterLab-IEUMITMis à jour il y a 3 moisSource →

Runs NCBI BLAST+ 2.17.0 sequence searches from the command line: makeblastdb (with -parse_seqids), blastn/blastp/blastx/tblastn with tabular -outfmt 6/7 for parsing, correct -task choice (megablast vs blastn vs blastn-short), -taxids/-negative_taxids taxonomic scoping, and -mt_mode multithreading; p

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59Étoiles du dépôt
1Clients
1Formats
il y a 3 moisDernière mise à jour
Skill
AuteurAlterLab-IEU
Version0.0.0
LicenceMIT
CatégorieWorkflow
Formatsskill.md
PromptNon publié
Compatibilité
Claude✓ Pris en charge
Cursor—
Copilot—
ChatGPT—
Gemini—
À propos

Runs NCBI BLAST+ 2.17.0 sequence searches from the command line: makeblastdb (with -parse_seqids), blastn/blastp/blastx/tblastn with tabular -outfmt 6/7 for parsing, correct -task choice (megablast vs blastn vs blastn-short), -taxids/-negative_taxids taxonomic scoping, and -mt_mode multithreading; plus a DIAMOND blastp --ultra-sensitive path for large protein searches. Warns that -max_target_seqs

Mots-clés
skillclaude

Aucune couverture des dépendances

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