alterlab-pydeseq2

SKILLWorkflowcommunauté
v0.0.0AlterLab-IEUMITMis à jour il y a 3 moisSource →

Run differential gene expression analysis on bulk RNA-seq count matrices with PyDESeq2, the Python port of DESeq2 — size-factor normalization, dispersion estimation, Wald tests, FDR (Benjamini-Hochberg) correction, and volcano/MA plots. Use when identifying differentially expressed genes between con

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59Étoiles du dépôt
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il y a 3 moisDernière mise à jour
Skill
AuteurAlterLab-IEU
Version0.0.0
LicenceMIT
CatégorieWorkflow
Formatsskill.md
PromptNon publié
Compatibilité
Claude✓ Pris en charge
Cursor—
Copilot—
ChatGPT—
Gemini—
À propos

Run differential gene expression analysis on bulk RNA-seq count matrices with PyDESeq2, the Python port of DESeq2 — size-factor normalization, dispersion estimation, Wald tests, FDR (Benjamini-Hochberg) correction, and volcano/MA plots. Use when identifying differentially expressed genes between conditions from raw bulk RNA-seq counts. Part of the AlterLab Academic Skills suite.

Mots-clés
skillclaude

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