alterlab-pysam

SKILLWorkflowcommunauté
v0.0.0AlterLab-IEUMITMis à jour il y a 3 moisSource →

Read and write genomic alignment and variant files in Python with pysam (htslib bindings) — SAM/BAM/CRAM alignments, VCF/BCF variants, and FASTA/FASTQ sequences, plus region extraction and per-base coverage/pileup. Use when scripting NGS data-processing pipelines that parse, filter, index, or comput

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59Étoiles du dépôt
1Clients
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il y a 3 moisDernière mise à jour
Skill
AuteurAlterLab-IEU
Version0.0.0
LicenceMIT
CatégorieWorkflow
Formatsskill.md
PromptNon publié
Compatibilité
Claude✓ Pris en charge
Cursor—
Copilot—
ChatGPT—
Gemini—
À propos

Read and write genomic alignment and variant files in Python with pysam (htslib bindings) — SAM/BAM/CRAM alignments, VCF/BCF variants, and FASTA/FASTQ sequences, plus region extraction and per-base coverage/pileup. Use when scripting NGS data-processing pipelines that parse, filter, index, or compute coverage over BAM/CRAM/VCF files. Part of the AlterLab Academic Skills suite.

Mots-clés
skillclaude

Aucune couverture des dépendances

Cette entrée ne publie aucun paquet npm : Forge n'a donc pas d'arbre de dépendances pour elle. C'est une lacune de couverture — pas une affirmation qu'elle n'a aucune dépendance.