bio-applied-assembly-sv

SKILLWorkflowcommunauté
v0.0.0Pavel-KravchenkoUnknownMis à jour il y a 3 moisSource →

Assemble ONT/HiFi reads with Flye/Hifiasm, polish with Medaka, QC with QUAST/BUSCO, call SVs (DEL/INS/INV/DUP/BND) with Sniffles2. Use for long-read assembly, N50/BUSCO QC, or nanopore/HiFi SV calling to VCF.

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4Étoiles du dépôt
1Clients
1Formats
il y a 3 moisDernière mise à jour
Skill
AuteurPavel-Kravchenko
Version0.0.0
LicenceUnknown
CatégorieWorkflow
Formatsskill.md
PromptNon publié
Compatibilité
Claude✓ Pris en charge
Cursor—
Copilot—
ChatGPT—
Gemini—
À propos

Assemble ONT/HiFi reads with Flye/Hifiasm, polish with Medaka, QC with QUAST/BUSCO, call SVs (DEL/INS/INV/DUP/BND) with Sniffles2. Use for long-read assembly, N50/BUSCO QC, or nanopore/HiFi SV calling to VCF.

Mots-clés
skillclaude

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