Rosetta/PyRosetta protein modeling and Biotite translation for computational biology
Author: Ariel J. Ben-Sasson A Model Context Protocol (MCP) server that lets Cursor (or any MCP client) work with Rosetta, PyRosetta, and Biotite: run RosettaScripts, validate XML protocols, translate between Rosetta and Biotite, score structures, and query documentation -- all from your AI coding assistant. -- Find the Biotite equivalent of any Rosetta function with working example code (21…
Déduit des transports déclarés par cette annonce (stdio). Un client absent de cette liste n’est pas écarté pour autant — c’est simplement quelque chose que Forge ne peut pas confirmer.
La vérification confirme l’identité de l’éditeur (la propriété du dépôt), pas la sûreté du code. L’analyse de sécurité couvre les CVE connues et les scripts d’installation suspects.
Lu dans le code que npm livre réellement, au moment de l’analyse. Le paquet n’a jamais été exécuté. Les outils enregistrés dynamiquement à l’exécution, ou cachés dans du code empaqueté ou minifié, peuvent passer inaperçus — c’est donc un plancher de la surface d’outils, pas un recensement complet.
get_rosetta_infoAucune description publiéeCet outil n’a publié aucune description. Forge n’en invente pas.
get_rosetta_helpAucune description publiéeCet outil n’a publié aucune description. Forge n’en invente pas.
validate_xmlAucune description publiéeCet outil n’a publié aucune description. Forge n’en invente pas.
run_rosetta_scriptsAucune description publiéeCet outil n’a publié aucune description. Forge n’en invente pas.
pyrosetta_scoreAucune description publiéeCet outil n’a publié aucune description. Forge n’en invente pas.
pyrosetta_introspectAucune description publiéeCet outil n’a publié aucune description. Forge n’en invente pas.
rosetta_scripts_schemaAucune description publiéeCet outil n’a publié aucune description. Forge n’en invente pas.
get_cached_docsAucune description publiéeCet outil n’a publié aucune description. Forge n’en invente pas.
python_env_infoAucune description publiéeCet outil n’a publié aucune description. Forge n’en invente pas.
check_pyrosettaAucune description publiéeCet outil n’a publié aucune description. Forge n’en invente pas.
install_pyrosetta_installerAucune description publiéeCet outil n’a publié aucune description. Forge n’en invente pas.
find_rosetta_scriptsAucune description publiéeCet outil n’a publié aucune description. Forge n’en invente pas.
xml_to_pyrosettaAucune description publiéeCet outil n’a publié aucune description. Forge n’en invente pas.
search_rosetta_web_docsAucune description publiéeCet outil n’a publié aucune description. Forge n’en invente pas.
get_rosetta_web_docAucune description publiéeCet outil n’a publié aucune description. Forge n’en invente pas.
rosetta_to_biotiteAucune description publiéeCet outil n’a publié aucune description. Forge n’en invente pas.
biotite_to_rosettaAucune description publiéeCet outil n’a publié aucune description. Forge n’en invente pas.
translate_rosetta_script_to_biotiteAucune description publiéeCet outil n’a publié aucune description. Forge n’en invente pas.
0 outils sur 18 ont publié une description.
Les noms et descriptions d’outils sont écrits par l’éditeur et affichés tels quels, comme du texte inerte. Ce sont les chaînes qu’un client MCP transmet à un modèle, alors Forge y recherche des motifs d’injection de prompt — tout constat apparaît avec l’analyse de sécurité ci-dessus. « Privilégié » est une correspondance de mot-clé sur le nom de l’outil, pas un audit de ce qu’il fait : un nom anodin peut tout de même tout faire.
Author: Ariel J. Ben-Sasson A Model Context Protocol (MCP) server that lets Cursor (or any MCP client) work with Rosetta, PyRosetta, and Biotite: run RosettaScripts, validate XML protocols, translate between Rosetta and Biotite, score structures, and query documentation -- all from your AI coding assistant. ** -- Find the Biotite equivalent of any Rosetta function with working example code (21 mappings covering structure I/O, SASA, RMSD, superimposition, secondary structure, contacts, hydrogen…
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