plink2-gwas-analysis

SKILLWorkflowcommunauté
v0.0.0jaechang-hitsNOASSERTIONMis à jour il y a 1 moisSource →

GWAS and population genetics tool. Processes PLINK (.bed/.bim/.fam), VCF, and BGEN; runs QC (MAF, HWE, missingness), IBD estimation, PCA, and linear/logistic regression GWAS. Outputs Manhattan-ready summary stats. Use regenie or SAIGE for biobanks (>100k samples) needing mixed models.

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336Étoiles du dépôt
1Clients
1Formats
il y a 1 moisDernière mise à jour
Skill
Auteurjaechang-hits
Version0.0.0
LicenceNOASSERTION
CatégorieWorkflow
Formatsskill.md
PromptNon publié
Compatibilité
Claude✓ Pris en charge
Cursor—
Copilot—
ChatGPT—
Gemini—
À propos

GWAS and population genetics tool. Processes PLINK (.bed/.bim/.fam), VCF, and BGEN; runs QC (MAF, HWE, missingness), IBD estimation, PCA, and linear/logistic regression GWAS. Outputs Manhattan-ready summary stats. Use regenie or SAIGE for biobanks (>100k samples) needing mixed models.

Mots-clés
skillclaude

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