alterlab-pydeseq2

SKILLFlusso di lavorocommunity
v0.0.0AlterLab-IEUMITAggiornato 3 mesi faFonte →

Run differential gene expression analysis on bulk RNA-seq count matrices with PyDESeq2, the Python port of DESeq2 — size-factor normalization, dispersion estimation, Wald tests, FDR (Benjamini-Hochberg) correction, and volcano/MA plots. Use when identifying differentially expressed genes between con

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59Stelle del repo
1Client
1Formati
3 mesi faUltimo aggiornamento
Skill
AutoreAlterLab-IEU
Versione0.0.0
LicenzaMIT
CategoriaFlusso di lavoro
Formatiskill.md
PromptNon pubblicato
Compatibilità
Claude✓ Supportato
Cursor—
Copilot—
ChatGPT—
Gemini—
Descrizione

Run differential gene expression analysis on bulk RNA-seq count matrices with PyDESeq2, the Python port of DESeq2 — size-factor normalization, dispersion estimation, Wald tests, FDR (Benjamini-Hochberg) correction, and volcano/MA plots. Use when identifying differentially expressed genes between conditions from raw bulk RNA-seq counts. Part of the AlterLab Academic Skills suite.

Parole chiave
skillclaude

Nessuna copertura delle dipendenze

Questa voce non pubblica alcun pacchetto npm, quindi Forge non ha un albero delle dipendenze per essa. È una lacuna di copertura, non l'affermazione che non abbia dipendenze.