bakta-genome-annotation

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Annotate bacterial and archaeal genomes and plasmids with Bakta's Prodigal/HMM/diamond pipeline. Identifies CDS, ncRNA, tRNA, rRNA, tmRNA, sORFs, CRISPR arrays, oriC/oriV/oriT, and gaps against a curated UniRef-derived database. Produces NCBI-compatible GFF3, GenBank, EMBL, JSON, FASTA, TSV, and a c

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1Client
1Formati
1 mesi faUltimo aggiornamento
Skill
Autorejaechang-hits
Versione0.0.0
LicenzaNOASSERTION
CategoriaFlusso di lavoro
Formatiskill.md
PromptNon pubblicato
Compatibilità
Claude✓ Supportato
Cursor—
Copilot—
ChatGPT—
Gemini—
Descrizione

Annotate bacterial and archaeal genomes and plasmids with Bakta's Prodigal/HMM/diamond pipeline. Identifies CDS, ncRNA, tRNA, rRNA, tmRNA, sORFs, CRISPR arrays, oriC/oriV/oriT, and gaps against a curated UniRef-derived database. Produces NCBI-compatible GFF3, GenBank, EMBL, JSON, FASTA, TSV, and a circular genome plot. Use Prokka for legacy pipelines or non-bacterial kingdoms; PGAP for NCBI GenBan

Parole chiave
skillclaude

Nessuna copertura delle dipendenze

Questa voce non pubblica alcun pacchetto npm, quindi Forge non ha un albero delle dipendenze per essa. È una lacuna di copertura, non l'affermazione che non abbia dipendenze.