bio-applied-differential-binding

SKILLFlujo de trabajocomunidad
v0.0.0Pavel-KravchenkoUnknownActualizado hace 3 mFuente →

Find ChIP-seq/ATAC-seq peaks that gain or lose signal between conditions using DiffBind (dba.count/dba.normalize/dba.analyze with DESeq2 or edgeR) on a consensus peak set, then annotate hits to genes/promoters with ChIPseeker annotatePeak. Use when comparing TF binding or histone marks across condit

Community-submitted skill. Not yet reviewed by the Forge team. Full prompt content may not be available.Request review →
4Estrellas del repo
1Clientes
1Formatos
hace 3 mÚltima actualización
Skill
AutorPavel-Kravchenko
Versión0.0.0
LicenciaUnknown
CategoríaFlujo de trabajo
Formatosskill.md
PromptNo publicado
Compatibilidad
Claude✓ Compatible
Cursor—
Copilot—
ChatGPT—
Gemini—
Acerca de

Find ChIP-seq/ATAC-seq peaks that gain or lose signal between conditions using DiffBind (dba.count/dba.normalize/dba.analyze with DESeq2 or edgeR) on a consensus peak set, then annotate hits to genes/promoters with ChIPseeker annotatePeak. Use when comparing TF binding or histone marks across conditions, building volcano/MA plots from dba.report() output, or annotating differential peaks to neares

Palabras clave
skillclaude

Sin cobertura de dependencias

Esta entrada no publica ningún paquete de npm, así que Forge no tiene un árbol de dependencias para ella. Es una carencia de cobertura, no una afirmación de que no tenga dependencias.